Program Studi S1 Ilmu Biologi FMIPA Universitas Negeri Manado (UNIMA) merupakan bagian integral dari perkembangan panjang Jurusan Biologi yang telah ada sejak masa awal berdirinya lembaga pendidikan tinggi di Sulawesi Utara. Cikal bakal program studi ini berawal dari berdirinya Perguruan Tinggi Pendidikan Guru (PTPG) Tondano pada tanggal 22 September 1955 berdasarkan Surat Keputusan Menteri Pendidikan, Pengajaran dan Kebudayaan Republik Indonesia Nomor 24511/Kab/1955. Pada masa tersebut, bidang biologi dikenal dengan nama Jurusan Ilmu Hayat, yang menjadi salah satu dari jurusan dalam rumpun Ilmu Pengetahuan Alam.

Seiring dengan dinamika perubahan kelembagaan, institusi ini mengalami berbagai transformasi, mulai dari menjadi FKIP Universitas Hasanuddin (1957), FKIP Sulawesi Utara dan Tengah (1961), hingga IKIP Yogyakarta Cabang Manado (1963). Pada periode tersebut, pengembangan bidang biologi tetap berlangsung di bawah naungan fakultas yang membidangi ilmu eksakta. Tonggak penting terjadi pada tahun 1965 ketika IKIP Manado resmi berdiri sebagai institusi mandiri, yang selanjutnya memperkuat eksistensi pendidikan biologi di daerah ini.

Perkembangan signifikan lainnya terjadi pada tahun 1982 ketika Fakultas Keguruan dan Ilmu Eksakta (FKIE) berubah menjadi Fakultas Pendidikan Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam (FPMIPA), yang kemudian menjadi wadah utama pengembangan disiplin ilmu sains, termasuk biologi. Transformasi kelembagaan mencapai puncaknya pada tahun 2000 melalui perubahan status IKIP Manado menjadi Universitas Negeri Manado (UNIMA), yang diikuti dengan perubahan FPMIPA menjadi Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam (FMIPA).

Dalam konteks pengembangan akademik, Jurusan Biologi kemudian membina dua program studi, yaitu Program Studi Pendidikan Biologi dan Program Studi Ilmu Biologi. Program Studi S1 Ilmu Biologi secara khusus diarahkan pada pengembangan ilmu biologi murni dan riset ilmiah.

Berdasarkan dokumen resmi Direktorat Jenderal Pendidikan Tinggi, keberadaan Program Studi S1 Biologi di Universitas Negeri Manado telah mendapatkan penataan dan penetapan kembali izin penyelenggaraan melalui Keputusan Direktur Jenderal Pendidikan Tinggi Nomor 61/DIKTI/Kep/2007 tanggal 2 April 2007 . Pada lampiran halaman 5 dokumen tersebut, tercantum bahwa Program Studi Biologi (S1) telah memiliki izin sebelumnya melalui keputusan Nomor 190/DIKTI/Kep/1998 tanggal 6 Oktober 1998, yang kemudian ditegaskan kembali masa berlakunya selama empat tahun sejak keputusan terbaru ditetapkan.

Sejak saat itu, Program Studi S1 Ilmu Biologi FMIPA UNIMA terus mengalami perkembangan baik dari segi kurikulum, sumber daya manusia, maupun sarana prasarana. Program studi ini berkomitmen untuk menghasilkan lulusan yang memiliki kompetensi dalam bidang biologi murni, mampu melakukan penelitian ilmiah, serta berkontribusi dalam pengembangan ilmu pengetahuan, khususnya yang berkaitan dengan biodiversitas dan kearifan lokal Sulawesi Utara.

Hingga saat ini, Program Studi S1 Ilmu Biologi FMIPA UNIMA tetap konsisten dalam menjalankan tridharma perguruan tinggi, yaitu pendidikan, penelitian, dan pengabdian kepada masyarakat, dengan orientasi pada pengembangan ilmu biologi yang berkelanjutan dan relevan dengan kebutuhan zaman.